Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNX29Q8TEQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX29Q8TEQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX29Q8TEQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX29Q8TEQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX29Q8TEQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms