Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRHL3Q8TE85 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRHL3Q8TE85 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms