Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACER1Q8TDN7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACER1Q8TDN7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACER1Q8TDN7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACER1Q8TDN7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms