Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACTRT1Q8TDG2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACTRT1Q8TDG2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACTRT1Q8TDG2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms