Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RASGRP4Q8TDF6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RASGRP4Q8TDF6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RASGRP4Q8TDF6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASGRP4Q8TDF6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms