Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDX54Q8TDD1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDX54Q8TDD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
DDX54Q8TDD1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DDX54Q8TDD1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms