Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CCER1Q8TC90 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCER1Q8TC90 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCER1Q8TC90 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCER1Q8TC90 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCER1Q8TC90 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCER1Q8TC90 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCER1Q8TC90 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms