Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM71BQ8TC56 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM71BQ8TC56 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms