Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA3Q8TBC4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA3Q8TBC4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBA3Q8TBC4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA3Q8TBC4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms