Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA9

VANGL1, Vang-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL1Q8TAA9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VANGL1Q8TAA9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VANGL1Q8TAA9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VANGL1Q8TAA9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms