Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYRIPQ8NFW9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYRIPQ8NFW9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYRIPQ8NFW9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms