Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEST4Q8NFU0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BEST4Q8NFU0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BEST4Q8NFU0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms