Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC148Q8NFR7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC148Q8NFR7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC148Q8NFR7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC148Q8NFR7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms