Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF397Q8NF99 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF397Q8NF99 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF397Q8NF99 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms