Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC112Q8NEF3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC112Q8NEF3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC112Q8NEF3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms