Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RDH13Q8NBN7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RDH13Q8NBN7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms