Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7E2

ZNF645, E3 ubiquitin-protein ligase ZNF645, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF645Q8N7E2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF645Q8N7E2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF645Q8N7E2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms