Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC185Q8N715 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC185Q8N715 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC185Q8N715 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms