Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C17orf53Q8N3J3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C17orf53Q8N3J3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C17orf53Q8N3J3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms