Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPICE1Q8N0Z3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPICE1Q8N0Z3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SPICE1Q8N0Z3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPICE1Q8N0Z3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms