Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL7

MSRB3, Methionine-R-sulfoxide reductase B3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB3Q8IXL7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MSRB3Q8IXL7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSRB3Q8IXL7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms