Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM48Q8IWZ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM48Q8IWZ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM48Q8IWZ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms