Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF13Q86YI8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF13Q86YI8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms