Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF39Q86UA1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF39Q86UA1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPF39Q86UA1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.8 ms