Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7D3

VTCN1, V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTCN1Q7Z7D3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VTCN1Q7Z7D3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTCN1Q7Z7D3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VTCN1Q7Z7D3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms