Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z442

PKD1L2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L2Q7Z442 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKD1L2Q7Z442 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKD1L2Q7Z442 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKD1L2Q7Z442 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD1L2Q7Z442 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKD1L2Q7Z442 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms