Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z410

TMPRSS9, Transmembrane protease serine 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS9Q7Z410 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS9Q7Z410 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS9Q7Z410 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms