Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
UBE3BQ7Z3V4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
UBE3BQ7Z3V4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE3BQ7Z3V4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UBE3BQ7Z3V4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms