Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CACNA2D4Q7Z3S7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CACNA2D4Q7Z3S7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms