Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LYSMD3Q7Z3D4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LYSMD3Q7Z3D4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYSMD3Q7Z3D4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms