Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATG9AQ7Z3C6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG9AQ7Z3C6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms