Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC16A9Q7RTY1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC16A9Q7RTY1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC16A9Q7RTY1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms