Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC29A4Q7RTT9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC29A4Q7RTT9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms