Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8C5

SYT13, Synaptotagmin-13, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT13Q7L8C5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT13Q7L8C5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT13Q7L8C5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT13Q7L8C5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms