Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RUFY3Q7L099 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RUFY3Q7L099 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY3Q7L099 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms