Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.78■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
KNDC1Q76NI1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KNDC1Q76NI1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KNDC1Q76NI1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
KNDC1Q76NI1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KNDC1Q76NI1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms