Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS27LQ71UM5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27LQ71UM5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS27LQ71UM5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms