Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHSY3Q70JA7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHSY3Q70JA7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms