Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAXIP1Q6ZW49 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PAXIP1Q6ZW49 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAXIP1Q6ZW49 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms