Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC36A4Q6YBV0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC36A4Q6YBV0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC36A4Q6YBV0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC36A4Q6YBV0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC36A4Q6YBV0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms