Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDPD4Q6W3E5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDPD4Q6W3E5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDPD4Q6W3E5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms