Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOA5Q6Q788 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOA5Q6Q788 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOA5Q6Q788 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOA5Q6Q788 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms