Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMED8Q6PL24 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMED8Q6PL24 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMED8Q6PL24 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMED8Q6PL24 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMED8Q6PL24 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMED8Q6PL24 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMED8Q6PL24 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMED8Q6PL24 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMED8Q6PL24 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMED8Q6PL24 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms