Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO42Q6P3S6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO42Q6P3S6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms