Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K8

GTF2H2C, General transcription factor IIH subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2CQ6P1K8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2H2CQ6P1K8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H2CQ6P1K8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms