Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRPL54Q6P161 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms