Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RWDD4Q6NW29 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD4Q6NW29 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD4Q6NW29 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD4Q6NW29 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms