Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPN13Q6MZZ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPN13Q6MZZ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN13Q6MZZ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms