Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SUMO4Q6EEV6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms