Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC19Q6DKK2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC19Q6DKK2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC19Q6DKK2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC19Q6DKK2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms